Protein–RNA interactions for Protein: P51888

PRELP, Prolargin, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELPP51888 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRELPP51888 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRELPP51888 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRELPP51888 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRELPP51888 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRELPP51888 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRELPP51888 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRELPP51888 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRELPP51888 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRELPP51888 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRELPP51888 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRELPP51888 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRELPP51888 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRELPP51888 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRELPP51888 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRELPP51888 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRELPP51888 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRELPP51888 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PRELPP51888 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PRELPP51888 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PRELPP51888 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PRELPP51888 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PRELPP51888 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PRELPP51888 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRELPP51888 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRELPP51888 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRELPP51888 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PRELPP51888 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRELPP51888 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PRELPP51888 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRELPP51888 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRELPP51888 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PRELPP51888 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PRELPP51888 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PRELPP51888 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRELPP51888 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PRELPP51888 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PRELPP51888 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRELPP51888 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRELPP51888 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRELPP51888 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRELPP51888 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRELPP51888 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PRELPP51888 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PRELPP51888 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
PRELPP51888 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRELPP51888 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PRELPP51888 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PRELPP51888 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRELPP51888 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRELPP51888 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PRELPP51888 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRELPP51888 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PRELPP51888 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRELPP51888 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PRELPP51888 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PRELPP51888 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRELPP51888 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRELPP51888 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PRELPP51888 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PRELPP51888 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRELPP51888 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRELPP51888 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
PRELPP51888 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRELPP51888 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PRELPP51888 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRELPP51888 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRELPP51888 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRELPP51888 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRELPP51888 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRELPP51888 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PRELPP51888 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRELPP51888 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRELPP51888 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRELPP51888 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRELPP51888 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PRELPP51888 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRELPP51888 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRELPP51888 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRELPP51888 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRELPP51888 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRELPP51888 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PRELPP51888 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRELPP51888 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRELPP51888 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PRELPP51888 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PRELPP51888 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRELPP51888 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRELPP51888 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRELPP51888 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRELPP51888 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRELPP51888 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRELPP51888 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRELPP51888 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRELPP51888 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRELPP51888 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRELPP51888 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRELPP51888 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PRELPP51888 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRELPP51888 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms