Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCR4P51679 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCR4P51679 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCR4P51679 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCR4P51679 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCR4P51679 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCR4P51679 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCR4P51679 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCR4P51679 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCR4P51679 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCR4P51679 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCR4P51679 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCR4P51679 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCR4P51679 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCR4P51679 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCR4P51679 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCR4P51679 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCR4P51679 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCR4P51679 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCR4P51679 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCR4P51679 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCR4P51679 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCR4P51679 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCR4P51679 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCR4P51679 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCR4P51679 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCR4P51679 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCR4P51679 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCR4P51679 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCR4P51679 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCR4P51679 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCR4P51679 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCR4P51679 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCR4P51679 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCR4P51679 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCR4P51679 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCR4P51679 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCR4P51679 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCR4P51679 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCR4P51679 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCR4P51679 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCR4P51679 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCR4P51679 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCR4P51679 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCR4P51679 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCR4P51679 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCR4P51679 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCR4P51679 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCR4P51679 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCR4P51679 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCR4P51679 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCR4P51679 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCR4P51679 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCR4P51679 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCR4P51679 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCR4P51679 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCR4P51679 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCR4P51679 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCR4P51679 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCR4P51679 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCR4P51679 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCR4P51679 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCR4P51679 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCR4P51679 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCR4P51679 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCR4P51679 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCR4P51679 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCR4P51679 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCR4P51679 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCR4P51679 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCR4P51679 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCR4P51679 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCR4P51679 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCR4P51679 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCR4P51679 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCR4P51679 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCR4P51679 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCR4P51679 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCR4P51679 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCR4P51679 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCR4P51679 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCR4P51679 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCR4P51679 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCR4P51679 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCR4P51679 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCR4P51679 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCR4P51679 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCR4P51679 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCR4P51679 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCR4P51679 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCR4P51679 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCR4P51679 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCR4P51679 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCR4P51679 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCR4P51679 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCR4P51679 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCR4P51679 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCR4P51679 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCR4P51679 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCR4P51679 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms