Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
DAP3P51398 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DAP3P51398 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DAP3P51398 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DAP3P51398 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DAP3P51398 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DAP3P51398 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
DAP3P51398 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
DAP3P51398 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DAP3P51398 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DAP3P51398 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
DAP3P51398 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DAP3P51398 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
DAP3P51398 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DAP3P51398 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DAP3P51398 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DAP3P51398 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DAP3P51398 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DAP3P51398 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
DAP3P51398 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DAP3P51398 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DAP3P51398 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DAP3P51398 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DAP3P51398 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DAP3P51398 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DAP3P51398 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DAP3P51398 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DAP3P51398 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DAP3P51398 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DAP3P51398 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DAP3P51398 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DAP3P51398 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DAP3P51398 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DAP3P51398 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DAP3P51398 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DAP3P51398 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DAP3P51398 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DAP3P51398 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DAP3P51398 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DAP3P51398 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
DAP3P51398 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DAP3P51398 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DAP3P51398 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DAP3P51398 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DAP3P51398 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DAP3P51398 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DAP3P51398 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DAP3P51398 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DAP3P51398 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DAP3P51398 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DAP3P51398 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DAP3P51398 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DAP3P51398 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DAP3P51398 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DAP3P51398 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DAP3P51398 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DAP3P51398 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DAP3P51398 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DAP3P51398 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DAP3P51398 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DAP3P51398 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DAP3P51398 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DAP3P51398 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DAP3P51398 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DAP3P51398 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DAP3P51398 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DAP3P51398 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DAP3P51398 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DAP3P51398 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DAP3P51398 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DAP3P51398 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DAP3P51398 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DAP3P51398 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DAP3P51398 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DAP3P51398 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DAP3P51398 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DAP3P51398 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DAP3P51398 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DAP3P51398 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DAP3P51398 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DAP3P51398 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
DAP3P51398 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DAP3P51398 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DAP3P51398 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DAP3P51398 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DAP3P51398 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DAP3P51398 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DAP3P51398 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DAP3P51398 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DAP3P51398 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DAP3P51398 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DAP3P51398 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DAP3P51398 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
DAP3P51398 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DAP3P51398 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DAP3P51398 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DAP3P51398 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DAP3P51398 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DAP3P51398 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
DAP3P51398 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms