Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BCAMP50895 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BCAMP50895 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCAMP50895 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCAMP50895 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCAMP50895 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCAMP50895 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCAMP50895 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCAMP50895 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCAMP50895 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCAMP50895 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCAMP50895 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCAMP50895 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCAMP50895 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCAMP50895 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCAMP50895 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCAMP50895 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCAMP50895 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCAMP50895 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCAMP50895 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
BCAMP50895 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCAMP50895 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCAMP50895 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCAMP50895 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
BCAMP50895 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCAMP50895 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCAMP50895 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCAMP50895 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCAMP50895 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
BCAMP50895 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BCAMP50895 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BCAMP50895 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BCAMP50895 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
BCAMP50895 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BCAMP50895 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
BCAMP50895 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BCAMP50895 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BCAMP50895 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BCAMP50895 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
BCAMP50895 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
BCAMP50895 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
BCAMP50895 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
BCAMP50895 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
BCAMP50895 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BCAMP50895 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BCAMP50895 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BCAMP50895 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BCAMP50895 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BCAMP50895 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BCAMP50895 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BCAMP50895 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BCAMP50895 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BCAMP50895 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BCAMP50895 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BCAMP50895 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BCAMP50895 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BCAMP50895 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BCAMP50895 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BCAMP50895 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BCAMP50895 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BCAMP50895 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BCAMP50895 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BCAMP50895 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BCAMP50895 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BCAMP50895 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BCAMP50895 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BCAMP50895 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BCAMP50895 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BCAMP50895 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BCAMP50895 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BCAMP50895 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BCAMP50895 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BCAMP50895 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
BCAMP50895 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BCAMP50895 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BCAMP50895 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BCAMP50895 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BCAMP50895 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BCAMP50895 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BCAMP50895 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
BCAMP50895 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BCAMP50895 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BCAMP50895 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BCAMP50895 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BCAMP50895 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BCAMP50895 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BCAMP50895 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BCAMP50895 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BCAMP50895 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BCAMP50895 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BCAMP50895 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BCAMP50895 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BCAMP50895 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
BCAMP50895 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BCAMP50895 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BCAMP50895 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BCAMP50895 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BCAMP50895 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BCAMP50895 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BCAMP50895 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms