Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CRIP1P50238 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms