Protein–RNA interactions for Protein: P49763

PGF, Placenta growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGFP49763 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PGFP49763 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGFP49763 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGFP49763 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGFP49763 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PGFP49763 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGFP49763 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGFP49763 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGFP49763 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGFP49763 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGFP49763 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGFP49763 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGFP49763 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PGFP49763 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGFP49763 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGFP49763 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGFP49763 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PGFP49763 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PGFP49763 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGFP49763 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PGFP49763 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PGFP49763 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGFP49763 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGFP49763 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGFP49763 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGFP49763 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGFP49763 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGFP49763 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGFP49763 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGFP49763 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGFP49763 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGFP49763 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGFP49763 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGFP49763 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGFP49763 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGFP49763 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGFP49763 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PGFP49763 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGFP49763 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PGFP49763 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGFP49763 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGFP49763 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGFP49763 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGFP49763 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGFP49763 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGFP49763 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PGFP49763 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PGFP49763 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PGFP49763 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PGFP49763 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PGFP49763 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGFP49763 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGFP49763 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGFP49763 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PGFP49763 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGFP49763 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGFP49763 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGFP49763 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGFP49763 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGFP49763 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGFP49763 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGFP49763 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGFP49763 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGFP49763 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGFP49763 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PGFP49763 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGFP49763 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGFP49763 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PGFP49763 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGFP49763 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGFP49763 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGFP49763 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGFP49763 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGFP49763 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGFP49763 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGFP49763 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGFP49763 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGFP49763 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGFP49763 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGFP49763 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGFP49763 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGFP49763 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGFP49763 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGFP49763 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGFP49763 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGFP49763 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGFP49763 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGFP49763 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGFP49763 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGFP49763 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGFP49763 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGFP49763 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGFP49763 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGFP49763 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGFP49763 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGFP49763 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGFP49763 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGFP49763 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGFP49763 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGFP49763 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms