Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNTBP49356 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FNTBP49356 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNTBP49356 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNTBP49356 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNTBP49356 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNTBP49356 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNTBP49356 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNTBP49356 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNTBP49356 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FNTBP49356 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNTBP49356 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNTBP49356 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNTBP49356 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FNTBP49356 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNTBP49356 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNTBP49356 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNTBP49356 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNTBP49356 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNTBP49356 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNTBP49356 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNTBP49356 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNTBP49356 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNTBP49356 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNTBP49356 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FNTBP49356 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNTBP49356 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNTBP49356 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNTBP49356 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNTBP49356 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNTBP49356 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNTBP49356 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNTBP49356 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNTBP49356 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FNTBP49356 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNTBP49356 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNTBP49356 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNTBP49356 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNTBP49356 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNTBP49356 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNTBP49356 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNTBP49356 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNTBP49356 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FNTBP49356 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNTBP49356 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNTBP49356 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNTBP49356 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNTBP49356 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNTBP49356 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNTBP49356 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNTBP49356 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNTBP49356 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNTBP49356 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNTBP49356 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNTBP49356 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNTBP49356 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FNTBP49356 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNTBP49356 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNTBP49356 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNTBP49356 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNTBP49356 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNTBP49356 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNTBP49356 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNTBP49356 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNTBP49356 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNTBP49356 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNTBP49356 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNTBP49356 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FNTBP49356 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNTBP49356 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNTBP49356 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNTBP49356 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNTBP49356 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNTBP49356 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNTBP49356 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNTBP49356 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNTBP49356 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNTBP49356 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNTBP49356 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNTBP49356 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNTBP49356 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNTBP49356 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNTBP49356 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNTBP49356 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNTBP49356 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNTBP49356 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FNTBP49356 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNTBP49356 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNTBP49356 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNTBP49356 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNTBP49356 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNTBP49356 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNTBP49356 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNTBP49356 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNTBP49356 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FNTBP49356 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNTBP49356 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNTBP49356 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNTBP49356 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNTBP49356 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms