Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPIAP49247 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPIAP49247 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPIAP49247 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPIAP49247 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPIAP49247 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPIAP49247 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPIAP49247 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPIAP49247 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPIAP49247 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPIAP49247 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPIAP49247 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPIAP49247 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPIAP49247 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPIAP49247 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPIAP49247 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPIAP49247 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPIAP49247 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPIAP49247 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPIAP49247 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPIAP49247 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPIAP49247 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPIAP49247 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPIAP49247 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPIAP49247 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPIAP49247 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RPIAP49247 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RPIAP49247 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPIAP49247 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPIAP49247 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPIAP49247 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPIAP49247 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPIAP49247 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPIAP49247 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPIAP49247 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPIAP49247 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPIAP49247 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPIAP49247 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPIAP49247 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPIAP49247 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPIAP49247 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPIAP49247 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPIAP49247 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPIAP49247 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPIAP49247 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RPIAP49247 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RPIAP49247 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RPIAP49247 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPIAP49247 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPIAP49247 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPIAP49247 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPIAP49247 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPIAP49247 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPIAP49247 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPIAP49247 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPIAP49247 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPIAP49247 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPIAP49247 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPIAP49247 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPIAP49247 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPIAP49247 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPIAP49247 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RPIAP49247 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RPIAP49247 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RPIAP49247 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RPIAP49247 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RPIAP49247 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPIAP49247 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPIAP49247 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPIAP49247 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPIAP49247 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPIAP49247 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RPIAP49247 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPIAP49247 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RPIAP49247 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPIAP49247 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPIAP49247 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPIAP49247 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPIAP49247 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPIAP49247 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RPIAP49247 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPIAP49247 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPIAP49247 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPIAP49247 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPIAP49247 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPIAP49247 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RPIAP49247 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPIAP49247 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RPIAP49247 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RPIAP49247 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPIAP49247 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPIAP49247 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPIAP49247 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPIAP49247 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPIAP49247 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPIAP49247 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPIAP49247 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPIAP49247 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPIAP49247 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPIAP49247 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms