Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms