Protein–RNA interactions for Protein: P48547

KCNC1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC1P48547 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms