Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIA4P48058 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIA4P48058 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms