Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPZBP47756 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms