Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms