Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms