Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms