Protein–RNA interactions for Protein: P43355

MAGEA1, Melanoma-associated antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA1P43355 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MAGEA1P43355 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MAGEA1P43355 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MAGEA1P43355 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MAGEA1P43355 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MAGEA1P43355 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms