Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSR1P43307 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSR1P43307 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSR1P43307 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSR1P43307 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSR1P43307 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSR1P43307 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SSR1P43307 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSR1P43307 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSR1P43307 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSR1P43307 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSR1P43307 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSR1P43307 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSR1P43307 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSR1P43307 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSR1P43307 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSR1P43307 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSR1P43307 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSR1P43307 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSR1P43307 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSR1P43307 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSR1P43307 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSR1P43307 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSR1P43307 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSR1P43307 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSR1P43307 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SSR1P43307 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSR1P43307 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSR1P43307 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSR1P43307 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSR1P43307 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SSR1P43307 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSR1P43307 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SSR1P43307 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSR1P43307 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SSR1P43307 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSR1P43307 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSR1P43307 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSR1P43307 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSR1P43307 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSR1P43307 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSR1P43307 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSR1P43307 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSR1P43307 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSR1P43307 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSR1P43307 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSR1P43307 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSR1P43307 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSR1P43307 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSR1P43307 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSR1P43307 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSR1P43307 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSR1P43307 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSR1P43307 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSR1P43307 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSR1P43307 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSR1P43307 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSR1P43307 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSR1P43307 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSR1P43307 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSR1P43307 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSR1P43307 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSR1P43307 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSR1P43307 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSR1P43307 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSR1P43307 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSR1P43307 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSR1P43307 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSR1P43307 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSR1P43307 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SSR1P43307 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSR1P43307 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSR1P43307 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSR1P43307 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSR1P43307 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSR1P43307 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSR1P43307 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSR1P43307 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSR1P43307 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSR1P43307 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSR1P43307 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSR1P43307 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSR1P43307 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSR1P43307 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSR1P43307 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSR1P43307 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSR1P43307 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSR1P43307 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSR1P43307 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SSR1P43307 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSR1P43307 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSR1P43307 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSR1P43307 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSR1P43307 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSR1P43307 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSR1P43307 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSR1P43307 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSR1P43307 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSR1P43307 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSR1P43307 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms