Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGER3P43115 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGER3P43115 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGER3P43115 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGER3P43115 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGER3P43115 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGER3P43115 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGER3P43115 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGER3P43115 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGER3P43115 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGER3P43115 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTGER3P43115 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms