Protein–RNA interactions for Protein: P38708

YHR020W, Putative proline--tRNA ligase YHR020W, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR020WP38708 TRM8YDL201W 861 nt5.6□□□□□ -1.51
YHR020WP38708 VMA16YHR026W 642 nt5.6□□□□□ -1.51
YHR020WP38708 HTD2YHR067W 843 nt5.6□□□□□ -1.51
YHR020WP38708 STM1YLR150W 822 nt5.6□□□□□ -1.51
YHR020WP38708 RUF5-1RUF5-1 710 nt5.6□□□□□ -1.51
YHR020WP38708 RUF5-2RUF5-2 710 nt5.6□□□□□ -1.51
YHR020WP38708 CYC2YOR037W 1101 nt5.6□□□□□ -1.51
YHR020WP38708 ERI1YPL096C-A 207 nt5.6□□□□□ -1.51
YHR020WP38708 SAP155YFR040W 3009 nt5.6□□□□□ -1.51
YHR020WP38708 YNL095CYNL095C 1929 nt5.6□□□□□ -1.51
YHR020WP38708 RTK1YDL025C 1863 nt5.6□□□□□ -1.51
YHR020WP38708 PWP1YLR196W 1731 nt5.6□□□□□ -1.51
YHR020WP38708 TRE2YOR256C 2430 nt5.59□□□□□ -1.51
YHR020WP38708 PRM7YDL039C 2097 nt5.59□□□□□ -1.51
YHR020WP38708 LAP3YNL239W 1365 nt5.59□□□□□ -1.51
YHR020WP38708 ECM32YER176W 3366 nt5.59□□□□□ -1.51
YHR020WP38708 KIN28YDL108W 921 nt5.59□□□□□ -1.51
YHR020WP38708 YDL144CYDL144C 1071 nt5.59□□□□□ -1.51
YHR020WP38708 ATO3YDR384C 828 nt5.59□□□□□ -1.51
YHR020WP38708 YGL230CYGL230C 444 nt5.59□□□□□ -1.51
YHR020WP38708 RPC25YKL144C 639 nt5.59□□□□□ -1.51
YHR020WP38708 GCD7YLR291C 1146 nt5.59□□□□□ -1.51
YHR020WP38708 PNO1YOR145C 825 nt5.59□□□□□ -1.51
YHR020WP38708 CAM1YPL048W 1248 nt5.59□□□□□ -1.51
YHR020WP38708 TBF1YPL128C 1689 nt5.59□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 NTH2YBR001C 2343 nt5.58□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt5.58□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 snR7-LsnR7-L 214 nt5.58□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 YRA1YDR381W 681 nt5.58□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 SYF2YGR129W 648 nt5.58□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 SPO11YHL022C 1197 nt5.58□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 YIL163CYIL163C 354 nt5.58□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 YJR096WYJR096W 849 nt5.58□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 CMC1YKL137W 336 nt5.58□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 SEC72YLR292C 582 nt5.58□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 PLP2YOR281C 861 nt5.58□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 YPR071WYPR071W 636 nt5.58□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 MSA1YOR066W 1890 nt5.58□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 MKS1YNL076W 1755 nt5.57□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 RFT1YBL020W 1725 nt5.57□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 YCL065WYCL065W 369 nt5.57□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 COG7YGL005C 840 nt5.57□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 BET1YIL004C 429 nt5.57□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 PAN6YIL145C 930 nt5.57□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 SPC2YML055W 537 nt5.57□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 YBL096CYBL096C 309 nt5.57□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 ARG1YOL058W 1263 nt5.57□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 RBD2YPL246C 789 nt5.57□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 Q0017Q0017 162 nt5.57□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 BRE2YLR015W 1518 nt5.57□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 AFT1YGL071W 2073 nt5.57□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 EXO1YOR033C 2109 nt5.56□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 MCX1YBR227C 1563 nt5.56□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 KXD1YGL079W 657 nt5.56□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 SDS3YIL084C 984 nt5.56□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 MTR2YKL186C 555 nt5.56□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 GAT3YLR013W 426 nt5.56□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 BMT2YBR141C 1014 nt5.56□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 HIR1YBL008W 2523 nt5.56□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 CYK3YDL117W 2658 nt5.55□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 APL6YGR261C 2430 nt5.55□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 YDL172CYDL172C 480 nt5.55□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 YGL193CYGL193C 312 nt5.55□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 AIR1YIL079C 1083 nt5.55□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 POL12YBL035C 2118 nt5.55□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 YMR245WYMR245W 621 nt5.55□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 PRX1YBL064C 786 nt5.55□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 ATG34YOL083W 1239 nt5.55□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 UFE1YOR075W 1041 nt5.55□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 SOF1YLL011W 1470 nt5.55□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 SIP5YMR140W 1470 nt5.55□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 MIH1YMR036C 1665 nt5.55□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 EAR1YMR171C 1653 nt5.55□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 SPO1YNL012W 1896 nt5.55□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 YRF1-4YLR466W 4149 nt5.55□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 OCA5YHL029C 2040 nt5.55□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 LEU1YGL009C 2340 nt5.54□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 UBC5YDR059C 447 nt5.54□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 YFR057WYFR057W 456 nt5.54□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 USB1YLR132C 873 nt5.54□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 RIF2YLR453C 1188 nt5.54□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 MRPL22YNL177C 930 nt5.54□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt5.54□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 YPL114WYPL114W 420 nt5.54□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 MBP1YDL056W 2502 nt5.54□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 SNF3YDL194W 2655 nt5.53□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 SYP1YCR030C 2613 nt5.53□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 SHM1YBR263W 1473 nt5.53□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 ALG11YNL048W 1647 nt5.53□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 VCX1YDL128W 1236 nt5.53□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 YFL012WYFL012W 447 nt5.53□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 YGL185CYGL185C 1140 nt5.53□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 TYS1YGR185C 1185 nt5.53□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 PCL7YIL050W 858 nt5.53□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 BOS1YLR078C 735 nt5.53□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 SSP120YLR250W 705 nt5.53□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 CSM3YMR048W 954 nt5.53□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 YNL144W-AYNL144W-A 84 nt5.53□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 CSL4YNL232W 879 nt5.53□□□□□ -1.52
YHR020WP38708 IRC13YOR235W 315 nt5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.2 ms