Protein–RNA interactions for Protein: P38571

LIPA, Lysosomal acid lipase/cholesteryl ester hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPAP38571 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LIPAP38571 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LIPAP38571 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LIPAP38571 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LIPAP38571 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LIPAP38571 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LIPAP38571 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LIPAP38571 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LIPAP38571 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LIPAP38571 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LIPAP38571 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LIPAP38571 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LIPAP38571 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LIPAP38571 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LIPAP38571 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LIPAP38571 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LIPAP38571 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LIPAP38571 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LIPAP38571 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LIPAP38571 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LIPAP38571 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LIPAP38571 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LIPAP38571 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LIPAP38571 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LIPAP38571 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LIPAP38571 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LIPAP38571 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LIPAP38571 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LIPAP38571 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LIPAP38571 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LIPAP38571 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LIPAP38571 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LIPAP38571 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LIPAP38571 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LIPAP38571 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LIPAP38571 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LIPAP38571 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LIPAP38571 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LIPAP38571 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LIPAP38571 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LIPAP38571 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIPAP38571 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIPAP38571 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIPAP38571 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIPAP38571 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIPAP38571 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIPAP38571 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIPAP38571 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIPAP38571 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIPAP38571 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIPAP38571 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LIPAP38571 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIPAP38571 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIPAP38571 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIPAP38571 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIPAP38571 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIPAP38571 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LIPAP38571 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LIPAP38571 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LIPAP38571 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LIPAP38571 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LIPAP38571 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LIPAP38571 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LIPAP38571 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LIPAP38571 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LIPAP38571 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LIPAP38571 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIPAP38571 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIPAP38571 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIPAP38571 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIPAP38571 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIPAP38571 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIPAP38571 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIPAP38571 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIPAP38571 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIPAP38571 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIPAP38571 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIPAP38571 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIPAP38571 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIPAP38571 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIPAP38571 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIPAP38571 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIPAP38571 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIPAP38571 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIPAP38571 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIPAP38571 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIPAP38571 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIPAP38571 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIPAP38571 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIPAP38571 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIPAP38571 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIPAP38571 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIPAP38571 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIPAP38571 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIPAP38571 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIPAP38571 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIPAP38571 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIPAP38571 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIPAP38571 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
LIPAP38571 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms