Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHRNA7P36544 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms