Protein–RNA interactions for Protein: P36026

UBP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, yeastyeast

Predictions only

Length 717 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBP11P36026 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt4.91□□□□□ -1.62
UBP11P36026 NAT3YPR131C 588 nt4.91□□□□□ -1.62
UBP11P36026 CLF1YLR117C 2064 nt4.91□□□□□ -1.62
UBP11P36026 GPR1YDL035C 2886 nt4.91□□□□□ -1.62
UBP11P36026 FOX2YKR009C 2703 nt4.91□□□□□ -1.62
UBP11P36026 STB3YDR169C 1542 nt4.91□□□□□ -1.62
UBP11P36026 YBR139WYBR139W 1527 nt4.91□□□□□ -1.62
UBP11P36026 ZRC1YMR243C 1329 nt4.91□□□□□ -1.62
UBP11P36026 MET12YPL023C 1974 nt4.91□□□□□ -1.62
UBP11P36026 CAF4YKR036C 1932 nt4.9□□□□□ -1.62
UBP11P36026 ZPR1YGR211W 1461 nt4.9□□□□□ -1.62
UBP11P36026 SUR2YDR297W 1050 nt4.9□□□□□ -1.63
UBP11P36026 ERG26YGL001C 1050 nt4.9□□□□□ -1.63
UBP11P36026 YKR047WYKR047W 306 nt4.9□□□□□ -1.63
UBP11P36026 SUI3YPL237W 858 nt4.9□□□□□ -1.63
UBP11P36026 TPS3YMR261C 3165 nt4.9□□□□□ -1.63
UBP11P36026 RIM15YFL033C 5313 nt4.9□□□□□ -1.63
UBP11P36026 AKL1YBR059C 3327 nt4.9□□□□□ -1.63
UBP11P36026 ABF1YKL112W 2196 nt4.89□□□□□ -1.63
UBP11P36026 YER085CYER085C 522 nt4.89□□□□□ -1.63
UBP11P36026 YER145C-AYER145C-A 438 nt4.89□□□□□ -1.63
UBP11P36026 BNA6YFR047C 888 nt4.89□□□□□ -1.63
UBP11P36026 YGL101WYGL101W 648 nt4.89□□□□□ -1.63
UBP11P36026 YIL165CYIL165C 360 nt4.89□□□□□ -1.63
UBP11P36026 DAN1YJR150C 897 nt4.89□□□□□ -1.63
UBP11P36026 YMR082CYMR082C 357 nt4.89□□□□□ -1.63
UBP11P36026 MSC2YDR205W 2175 nt4.88□□□□□ -1.63
UBP11P36026 LHP1YDL051W 828 nt4.88□□□□□ -1.63
UBP11P36026 COS4YFL062W 1140 nt4.88□□□□□ -1.63
UBP11P36026 YHR212W-AYHR212W-A 204 nt4.88□□□□□ -1.63
UBP11P36026 YAR061WYAR061W 204 nt4.88□□□□□ -1.63
UBP11P36026 COS3YML132W 1140 nt4.88□□□□□ -1.63
UBP11P36026 COS2YBR302C 1140 nt4.88□□□□□ -1.63
UBP11P36026 GAS5YOL030W 1455 nt4.88□□□□□ -1.63
UBP11P36026 YDR444WYDR444W 2064 nt4.87□□□□□ -1.63
UBP11P36026 MUP3YHL036W 1641 nt4.87□□□□□ -1.63
UBP11P36026 GDB1YPR184W 4611 nt4.87□□□□□ -1.63
UBP11P36026 MOT2YER068W 1764 nt4.87□□□□□ -1.63
UBP11P36026 ENT5YDR153C 1236 nt4.87□□□□□ -1.63
UBP11P36026 YDR249CYDR249C 1122 nt4.87□□□□□ -1.63
UBP11P36026 YLR374CYLR374C 390 nt4.87□□□□□ -1.63
UBP11P36026 YOR379CYOR379C 339 nt4.87□□□□□ -1.63
UBP11P36026 DIT2YDR402C 1470 nt4.87□□□□□ -1.63
UBP11P36026 TYS1YGR185C 1185 nt4.86□□□□□ -1.63
UBP11P36026 ARD1YHR013C 717 nt4.86□□□□□ -1.63
UBP11P36026 YHR137C-AYHR137C-A 651 nt4.86□□□□□ -1.63
UBP11P36026 MRT4YKL009W 711 nt4.86□□□□□ -1.63
UBP11P36026 RRN9YMR270C 1098 nt4.86□□□□□ -1.63
UBP11P36026 PDX3YBR035C 687 nt4.86□□□□□ -1.63
UBP11P36026 VPS28YPL065W 729 nt4.86□□□□□ -1.63
UBP11P36026 POS5YPL188W 1245 nt4.86□□□□□ -1.63
UBP11P36026 MSE1YOL033W 1611 nt4.86□□□□□ -1.63
UBP11P36026 MNT2YGL257C 1677 nt4.86□□□□□ -1.63
UBP11P36026 CAB3YKL088W 1716 nt4.86□□□□□ -1.63
UBP11P36026 YPS7YDR349C 1791 nt4.86□□□□□ -1.63
UBP11P36026 PRM2YIL037C 1971 nt4.85□□□□□ -1.63
UBP11P36026 PCA1YBR295W 3651 nt4.85□□□□□ -1.63
UBP11P36026 YIL152WYIL152W 708 nt4.85□□□□□ -1.63
UBP11P36026 LTO1YNL260C 597 nt4.85□□□□□ -1.63
UBP11P36026 CUS2YNL286W 858 nt4.85□□□□□ -1.63
UBP11P36026 RER1YCL001W 567 nt4.85□□□□□ -1.63
UBP11P36026 ARO9YHR137W 1542 nt4.85□□□□□ -1.63
UBP11P36026 MNN4YKL201C 3537 nt4.85□□□□□ -1.63
UBP11P36026 GDH2YDL215C 3279 nt4.84□□□□□ -1.63
UBP11P36026 HRK1YOR267C 2280 nt4.84□□□□□ -1.63
UBP11P36026 GGA1YDR358W 1674 nt4.84□□□□□ -1.63
UBP11P36026 FRT2YAL028W 1587 nt4.84□□□□□ -1.63
UBP11P36026 NPY1YGL067W 1155 nt4.84□□□□□ -1.63
UBP11P36026 CDC21YOR074C 915 nt4.84□□□□□ -1.63
UBP11P36026 SPN1YPR133C 1233 nt4.84□□□□□ -1.63
UBP11P36026 KRE6YPR159W 2163 nt4.84□□□□□ -1.64
UBP11P36026 GSY1YFR015C 2127 nt4.84□□□□□ -1.64
UBP11P36026 SIR1YKR101W 1965 nt4.84□□□□□ -1.64
UBP11P36026 RKM2YDR198C 1440 nt4.83□□□□□ -1.64
UBP11P36026 TSL1YML100W 3297 nt4.83□□□□□ -1.64
UBP11P36026 SPR28YDR218C 1272 nt4.83□□□□□ -1.64
UBP11P36026 YER133W-AYER133W-A 342 nt4.83□□□□□ -1.64
UBP11P36026 YGR016WYGR016W 573 nt4.83□□□□□ -1.64
UBP11P36026 NDJ1YOL104C 1059 nt4.83□□□□□ -1.64
UBP11P36026 TCM62YBR044C 1719 nt4.83□□□□□ -1.64
UBP11P36026 CNA1YLR433C 1662 nt4.83□□□□□ -1.64
UBP11P36026 AXL2YIL140W 2472 nt4.82□□□□□ -1.64
UBP11P36026 ESF1YDR365C 1887 nt4.82□□□□□ -1.64
UBP11P36026 YDL241WYDL241W 372 nt4.82□□□□□ -1.64
UBP11P36026 GCV1YDR019C 1203 nt4.82□□□□□ -1.64
UBP11P36026 ACT1YFL039C 1128 nt4.82□□□□□ -1.64
UBP11P36026 DUO1YGL061C 744 nt4.82□□□□□ -1.64
UBP11P36026 BMT5YIL096C 1011 nt4.82□□□□□ -1.64
UBP11P36026 LSO1YJR005C-A 282 nt4.82□□□□□ -1.64
UBP11P36026 OMA1YKR087C 1038 nt4.82□□□□□ -1.64
UBP11P36026 YIM2YMR151W 438 nt4.82□□□□□ -1.64
UBP11P36026 RRP40YOL142W 723 nt4.82□□□□□ -1.64
UBP11P36026 OPY2YPR075C 1083 nt4.82□□□□□ -1.64
UBP11P36026 RGP1YDR137W 1992 nt4.82□□□□□ -1.64
UBP11P36026 PDR15YDR406W 4590 nt4.81□□□□□ -1.64
UBP11P36026 RAD16YBR114W 2373 nt4.81□□□□□ -1.64
UBP11P36026 KIN28YDL108W 921 nt4.81□□□□□ -1.64
UBP11P36026 MPC1YGL080W 393 nt4.81□□□□□ -1.64
UBP11P36026 FRA2YGL220W 363 nt4.81□□□□□ -1.64
UBP11P36026 FMP33YJL161W 543 nt4.81□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12 ms