Protein–RNA interactions for Protein: P35913

PDE6B, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6BP35913 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE6BP35913 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE6BP35913 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE6BP35913 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE6BP35913 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE6BP35913 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE6BP35913 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE6BP35913 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE6BP35913 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE6BP35913 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE6BP35913 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE6BP35913 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE6BP35913 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE6BP35913 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE6BP35913 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE6BP35913 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE6BP35913 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE6BP35913 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE6BP35913 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE6BP35913 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE6BP35913 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE6BP35913 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE6BP35913 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
PDE6BP35913 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PDE6BP35913 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PDE6BP35913 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE6BP35913 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PDE6BP35913 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PDE6BP35913 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PDE6BP35913 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE6BP35913 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE6BP35913 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE6BP35913 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE6BP35913 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE6BP35913 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE6BP35913 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE6BP35913 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE6BP35913 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE6BP35913 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE6BP35913 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE6BP35913 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE6BP35913 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE6BP35913 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms