Protein–RNA interactions for Protein: P35790

CHKA, Choline kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKAP35790 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHKAP35790 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHKAP35790 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHKAP35790 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHKAP35790 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHKAP35790 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHKAP35790 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHKAP35790 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHKAP35790 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHKAP35790 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHKAP35790 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHKAP35790 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHKAP35790 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHKAP35790 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHKAP35790 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHKAP35790 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHKAP35790 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHKAP35790 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHKAP35790 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHKAP35790 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHKAP35790 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHKAP35790 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHKAP35790 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHKAP35790 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHKAP35790 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHKAP35790 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CHKAP35790 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHKAP35790 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHKAP35790 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHKAP35790 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHKAP35790 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHKAP35790 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHKAP35790 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHKAP35790 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CHKAP35790 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHKAP35790 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHKAP35790 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHKAP35790 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHKAP35790 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHKAP35790 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHKAP35790 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHKAP35790 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHKAP35790 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHKAP35790 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHKAP35790 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHKAP35790 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHKAP35790 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CHKAP35790 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHKAP35790 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHKAP35790 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHKAP35790 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHKAP35790 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHKAP35790 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHKAP35790 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHKAP35790 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHKAP35790 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHKAP35790 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHKAP35790 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHKAP35790 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHKAP35790 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHKAP35790 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHKAP35790 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHKAP35790 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHKAP35790 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHKAP35790 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHKAP35790 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHKAP35790 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CHKAP35790 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHKAP35790 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHKAP35790 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHKAP35790 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHKAP35790 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHKAP35790 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHKAP35790 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHKAP35790 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHKAP35790 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHKAP35790 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHKAP35790 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHKAP35790 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHKAP35790 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHKAP35790 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHKAP35790 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHKAP35790 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHKAP35790 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHKAP35790 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHKAP35790 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHKAP35790 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHKAP35790 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHKAP35790 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHKAP35790 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHKAP35790 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CHKAP35790 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHKAP35790 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CHKAP35790 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHKAP35790 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHKAP35790 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHKAP35790 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHKAP35790 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHKAP35790 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHKAP35790 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms