Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPC1P35052 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPC1P35052 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPC1P35052 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPC1P35052 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPC1P35052 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPC1P35052 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPC1P35052 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GPC1P35052 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPC1P35052 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPC1P35052 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPC1P35052 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPC1P35052 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPC1P35052 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPC1P35052 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPC1P35052 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPC1P35052 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPC1P35052 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPC1P35052 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPC1P35052 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPC1P35052 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPC1P35052 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPC1P35052 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPC1P35052 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPC1P35052 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GPC1P35052 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPC1P35052 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPC1P35052 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPC1P35052 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPC1P35052 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPC1P35052 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPC1P35052 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPC1P35052 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GPC1P35052 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPC1P35052 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPC1P35052 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GPC1P35052 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPC1P35052 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPC1P35052 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPC1P35052 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GPC1P35052 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPC1P35052 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPC1P35052 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPC1P35052 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPC1P35052 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPC1P35052 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPC1P35052 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPC1P35052 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GPC1P35052 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GPC1P35052 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPC1P35052 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPC1P35052 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPC1P35052 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPC1P35052 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPC1P35052 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GPC1P35052 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPC1P35052 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPC1P35052 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPC1P35052 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPC1P35052 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPC1P35052 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GPC1P35052 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPC1P35052 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GPC1P35052 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GPC1P35052 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPC1P35052 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPC1P35052 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPC1P35052 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GPC1P35052 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GPC1P35052 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GPC1P35052 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GPC1P35052 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GPC1P35052 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPC1P35052 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GPC1P35052 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPC1P35052 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPC1P35052 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPC1P35052 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPC1P35052 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPC1P35052 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPC1P35052 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPC1P35052 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPC1P35052 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPC1P35052 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPC1P35052 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPC1P35052 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPC1P35052 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPC1P35052 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPC1P35052 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPC1P35052 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPC1P35052 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPC1P35052 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPC1P35052 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPC1P35052 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPC1P35052 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPC1P35052 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPC1P35052 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPC1P35052 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPC1P35052 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPC1P35052 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms