Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCND3P30281 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCND3P30281 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCND3P30281 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCND3P30281 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCND3P30281 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCND3P30281 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCND3P30281 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCND3P30281 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCND3P30281 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCND3P30281 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCND3P30281 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCND3P30281 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCND3P30281 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCND3P30281 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCND3P30281 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCND3P30281 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCND3P30281 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCND3P30281 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCND3P30281 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCND3P30281 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCND3P30281 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCND3P30281 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCND3P30281 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCND3P30281 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCND3P30281 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCND3P30281 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCND3P30281 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCND3P30281 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCND3P30281 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCND3P30281 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCND3P30281 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCND3P30281 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCND3P30281 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCND3P30281 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCND3P30281 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCND3P30281 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCND3P30281 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCND3P30281 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCND3P30281 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCND3P30281 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCND3P30281 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCND3P30281 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCND3P30281 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCND3P30281 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCND3P30281 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCND3P30281 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCND3P30281 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCND3P30281 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCND3P30281 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCND3P30281 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCND3P30281 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCND3P30281 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCND3P30281 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCND3P30281 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCND3P30281 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCND3P30281 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCND3P30281 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCND3P30281 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCND3P30281 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCND3P30281 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCND3P30281 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCND3P30281 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCND3P30281 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCND3P30281 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCND3P30281 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCND3P30281 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCND3P30281 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCND3P30281 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCND3P30281 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCND3P30281 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCND3P30281 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCND3P30281 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCND3P30281 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCND3P30281 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCND3P30281 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCND3P30281 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCND3P30281 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCND3P30281 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCND3P30281 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCND3P30281 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCND3P30281 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCND3P30281 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCND3P30281 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCND3P30281 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCND3P30281 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCND3P30281 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCND3P30281 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCND3P30281 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCND3P30281 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCND3P30281 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCND3P30281 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCND3P30281 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCND3P30281 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCND3P30281 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCND3P30281 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCND3P30281 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCND3P30281 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCND3P30281 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCND3P30281 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms