Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCSK1P29120 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PCSK1P29120 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCSK1P29120 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCSK1P29120 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCSK1P29120 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCSK1P29120 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCSK1P29120 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCSK1P29120 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCSK1P29120 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCSK1P29120 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCSK1P29120 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCSK1P29120 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCSK1P29120 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCSK1P29120 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCSK1P29120 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCSK1P29120 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCSK1P29120 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCSK1P29120 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCSK1P29120 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCSK1P29120 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCSK1P29120 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCSK1P29120 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCSK1P29120 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCSK1P29120 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCSK1P29120 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCSK1P29120 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCSK1P29120 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PCSK1P29120 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms