Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GJB2P29033 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GJB2P29033 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GJB2P29033 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJB2P29033 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJB2P29033 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJB2P29033 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJB2P29033 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJB2P29033 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJB2P29033 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJB2P29033 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJB2P29033 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJB2P29033 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJB2P29033 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJB2P29033 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJB2P29033 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJB2P29033 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJB2P29033 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GJB2P29033 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJB2P29033 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJB2P29033 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJB2P29033 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJB2P29033 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJB2P29033 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJB2P29033 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJB2P29033 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJB2P29033 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJB2P29033 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJB2P29033 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJB2P29033 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJB2P29033 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJB2P29033 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJB2P29033 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJB2P29033 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJB2P29033 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJB2P29033 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJB2P29033 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJB2P29033 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJB2P29033 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJB2P29033 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJB2P29033 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJB2P29033 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJB2P29033 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GJB2P29033 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GJB2P29033 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GJB2P29033 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJB2P29033 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJB2P29033 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJB2P29033 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJB2P29033 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GJB2P29033 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJB2P29033 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJB2P29033 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJB2P29033 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJB2P29033 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJB2P29033 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJB2P29033 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJB2P29033 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJB2P29033 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJB2P29033 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJB2P29033 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJB2P29033 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJB2P29033 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GJB2P29033 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJB2P29033 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJB2P29033 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJB2P29033 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJB2P29033 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJB2P29033 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJB2P29033 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJB2P29033 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJB2P29033 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJB2P29033 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJB2P29033 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJB2P29033 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJB2P29033 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJB2P29033 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GJB2P29033 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJB2P29033 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GJB2P29033 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJB2P29033 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJB2P29033 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJB2P29033 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJB2P29033 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJB2P29033 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJB2P29033 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJB2P29033 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJB2P29033 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJB2P29033 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJB2P29033 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJB2P29033 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJB2P29033 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJB2P29033 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJB2P29033 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJB2P29033 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJB2P29033 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJB2P29033 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJB2P29033 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJB2P29033 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJB2P29033 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms