Protein–RNA interactions for Protein: P29017

CD1C, T-cell surface glycoprotein CD1c, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD1CP29017 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CD1CP29017 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD1CP29017 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD1CP29017 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD1CP29017 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD1CP29017 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD1CP29017 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD1CP29017 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD1CP29017 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CD1CP29017 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD1CP29017 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD1CP29017 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD1CP29017 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD1CP29017 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD1CP29017 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD1CP29017 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD1CP29017 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD1CP29017 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD1CP29017 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD1CP29017 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD1CP29017 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD1CP29017 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD1CP29017 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD1CP29017 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD1CP29017 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CD1CP29017 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CD1CP29017 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CD1CP29017 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD1CP29017 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD1CP29017 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD1CP29017 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD1CP29017 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD1CP29017 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD1CP29017 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CD1CP29017 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD1CP29017 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD1CP29017 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CD1CP29017 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD1CP29017 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD1CP29017 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD1CP29017 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD1CP29017 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD1CP29017 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD1CP29017 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD1CP29017 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD1CP29017 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD1CP29017 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD1CP29017 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD1CP29017 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CD1CP29017 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD1CP29017 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CD1CP29017 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD1CP29017 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD1CP29017 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD1CP29017 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD1CP29017 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD1CP29017 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD1CP29017 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD1CP29017 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD1CP29017 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD1CP29017 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD1CP29017 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD1CP29017 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD1CP29017 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CD1CP29017 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD1CP29017 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD1CP29017 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD1CP29017 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD1CP29017 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD1CP29017 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD1CP29017 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD1CP29017 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD1CP29017 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD1CP29017 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD1CP29017 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD1CP29017 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD1CP29017 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD1CP29017 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD1CP29017 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD1CP29017 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD1CP29017 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD1CP29017 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD1CP29017 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD1CP29017 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD1CP29017 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CD1CP29017 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD1CP29017 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD1CP29017 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD1CP29017 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD1CP29017 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD1CP29017 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD1CP29017 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD1CP29017 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD1CP29017 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD1CP29017 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD1CP29017 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD1CP29017 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD1CP29017 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD1CP29017 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD1CP29017 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms