Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PEX2P28328 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PEX2P28328 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PEX2P28328 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PEX2P28328 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PEX2P28328 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PEX2P28328 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PEX2P28328 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PEX2P28328 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PEX2P28328 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PEX2P28328 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PEX2P28328 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PEX2P28328 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PEX2P28328 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PEX2P28328 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PEX2P28328 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PEX2P28328 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PEX2P28328 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PEX2P28328 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PEX2P28328 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PEX2P28328 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PEX2P28328 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PEX2P28328 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PEX2P28328 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PEX2P28328 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PEX2P28328 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PEX2P28328 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PEX2P28328 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PEX2P28328 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PEX2P28328 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PEX2P28328 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PEX2P28328 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PEX2P28328 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PEX2P28328 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PEX2P28328 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PEX2P28328 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PEX2P28328 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PEX2P28328 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PEX2P28328 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PEX2P28328 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PEX2P28328 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PEX2P28328 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PEX2P28328 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PEX2P28328 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PEX2P28328 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PEX2P28328 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PEX2P28328 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PEX2P28328 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PEX2P28328 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PEX2P28328 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PEX2P28328 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PEX2P28328 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PEX2P28328 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PEX2P28328 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PEX2P28328 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PEX2P28328 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PEX2P28328 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PEX2P28328 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PEX2P28328 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PEX2P28328 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PEX2P28328 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PEX2P28328 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PEX2P28328 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PEX2P28328 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PEX2P28328 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PEX2P28328 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PEX2P28328 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PEX2P28328 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PEX2P28328 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PEX2P28328 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PEX2P28328 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PEX2P28328 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PEX2P28328 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PEX2P28328 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PEX2P28328 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PEX2P28328 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PEX2P28328 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PEX2P28328 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PEX2P28328 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PEX2P28328 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PEX2P28328 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PEX2P28328 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PEX2P28328 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PEX2P28328 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PEX2P28328 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PEX2P28328 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PEX2P28328 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PEX2P28328 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PEX2P28328 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PEX2P28328 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PEX2P28328 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PEX2P28328 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PEX2P28328 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PEX2P28328 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PEX2P28328 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PEX2P28328 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PEX2P28328 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PEX2P28328 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PEX2P28328 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PEX2P28328 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms