Protein–RNA interactions for Protein: P27540

ARNT, Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARNTP27540 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARNTP27540 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARNTP27540 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARNTP27540 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARNTP27540 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARNTP27540 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARNTP27540 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARNTP27540 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARNTP27540 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARNTP27540 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARNTP27540 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARNTP27540 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARNTP27540 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARNTP27540 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARNTP27540 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARNTP27540 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARNTP27540 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARNTP27540 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARNTP27540 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARNTP27540 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARNTP27540 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARNTP27540 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ARNTP27540 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARNTP27540 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARNTP27540 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARNTP27540 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARNTP27540 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARNTP27540 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARNTP27540 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARNTP27540 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARNTP27540 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARNTP27540 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARNTP27540 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARNTP27540 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARNTP27540 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARNTP27540 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARNTP27540 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARNTP27540 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARNTP27540 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARNTP27540 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARNTP27540 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARNTP27540 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARNTP27540 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ARNTP27540 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARNTP27540 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARNTP27540 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARNTP27540 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARNTP27540 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARNTP27540 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARNTP27540 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARNTP27540 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARNTP27540 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARNTP27540 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARNTP27540 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARNTP27540 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARNTP27540 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARNTP27540 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARNTP27540 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARNTP27540 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARNTP27540 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARNTP27540 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARNTP27540 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARNTP27540 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ARNTP27540 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ARNTP27540 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ARNTP27540 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARNTP27540 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARNTP27540 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARNTP27540 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARNTP27540 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARNTP27540 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARNTP27540 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARNTP27540 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARNTP27540 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARNTP27540 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARNTP27540 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARNTP27540 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARNTP27540 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARNTP27540 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARNTP27540 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARNTP27540 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARNTP27540 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARNTP27540 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARNTP27540 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARNTP27540 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARNTP27540 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARNTP27540 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARNTP27540 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ARNTP27540 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARNTP27540 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARNTP27540 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARNTP27540 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARNTP27540 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARNTP27540 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ARNTP27540 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARNTP27540 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARNTP27540 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARNTP27540 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARNTP27540 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARNTP27540 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms