Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLNP26678 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLNP26678 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PLNP26678 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLNP26678 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLNP26678 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLNP26678 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLNP26678 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLNP26678 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLNP26678 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLNP26678 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLNP26678 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLNP26678 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLNP26678 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLNP26678 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLNP26678 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLNP26678 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLNP26678 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLNP26678 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLNP26678 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PLNP26678 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PLNP26678 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PLNP26678 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PLNP26678 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PLNP26678 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PLNP26678 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLNP26678 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLNP26678 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLNP26678 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLNP26678 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLNP26678 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLNP26678 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLNP26678 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PLNP26678 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLNP26678 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLNP26678 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLNP26678 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLNP26678 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLNP26678 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLNP26678 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLNP26678 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLNP26678 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLNP26678 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLNP26678 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLNP26678 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLNP26678 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLNP26678 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLNP26678 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLNP26678 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLNP26678 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLNP26678 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLNP26678 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLNP26678 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PLNP26678 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLNP26678 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLNP26678 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLNP26678 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLNP26678 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PLNP26678 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLNP26678 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLNP26678 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLNP26678 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLNP26678 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLNP26678 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLNP26678 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLNP26678 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLNP26678 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLNP26678 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLNP26678 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLNP26678 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLNP26678 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLNP26678 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLNP26678 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLNP26678 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLNP26678 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLNP26678 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLNP26678 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLNP26678 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PLNP26678 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLNP26678 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLNP26678 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLNP26678 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLNP26678 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLNP26678 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLNP26678 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLNP26678 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLNP26678 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLNP26678 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLNP26678 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLNP26678 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLNP26678 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PLNP26678 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLNP26678 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLNP26678 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLNP26678 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLNP26678 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLNP26678 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLNP26678 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLNP26678 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLNP26678 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms