Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HMGB2P26583 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HMGB2P26583 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HMGB2P26583 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HMGB2P26583 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HMGB2P26583 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HMGB2P26583 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HMGB2P26583 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
HMGB2P26583 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HMGB2P26583 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HMGB2P26583 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HMGB2P26583 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HMGB2P26583 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HMGB2P26583 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
HMGB2P26583 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HMGB2P26583 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HMGB2P26583 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HMGB2P26583 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HMGB2P26583 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HMGB2P26583 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HMGB2P26583 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HMGB2P26583 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HMGB2P26583 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HMGB2P26583 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HMGB2P26583 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HMGB2P26583 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HMGB2P26583 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HMGB2P26583 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HMGB2P26583 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HMGB2P26583 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HMGB2P26583 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HMGB2P26583 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HMGB2P26583 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HMGB2P26583 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
HMGB2P26583 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HMGB2P26583 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
HMGB2P26583 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HMGB2P26583 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HMGB2P26583 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HMGB2P26583 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
HMGB2P26583 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms