Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
DNMT1P26358 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
DNMT1P26358 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
DNMT1P26358 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
DNMT1P26358 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
DNMT1P26358 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC33.93■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.9■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC33.89■■■■□ 3.02
DNMT1P26358 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
DNMT1P26358 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
DNMT1P26358 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
DNMT1P26358 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
DNMT1P26358 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
DNMT1P26358 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
DNMT1P26358 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
DNMT1P26358 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
DNMT1P26358 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
DNMT1P26358 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
DNMT1P26358 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
DNMT1P26358 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
DNMT1P26358 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
DNMT1P26358 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
DNMT1P26358 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
DNMT1P26358 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
DNMT1P26358 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
DNMT1P26358 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
DNMT1P26358 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
DNMT1P26358 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
DNMT1P26358 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
DNMT1P26358 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
DNMT1P26358 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
DNMT1P26358 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
DNMT1P26358 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
DNMT1P26358 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
DNMT1P26358 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
DNMT1P26358 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
DNMT1P26358 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC33.84■■■■□ 3.01
DNMT1P26358 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
DNMT1P26358 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
DNMT1P26358 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
DNMT1P26358 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
DNMT1P26358 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
DNMT1P26358 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
DNMT1P26358 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
DNMT1P26358 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms