Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTX3P26022 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTX3P26022 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTX3P26022 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTX3P26022 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTX3P26022 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTX3P26022 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTX3P26022 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTX3P26022 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTX3P26022 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTX3P26022 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTX3P26022 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTX3P26022 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTX3P26022 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTX3P26022 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTX3P26022 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTX3P26022 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTX3P26022 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTX3P26022 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTX3P26022 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTX3P26022 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTX3P26022 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTX3P26022 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTX3P26022 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTX3P26022 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTX3P26022 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTX3P26022 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTX3P26022 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTX3P26022 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTX3P26022 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTX3P26022 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTX3P26022 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTX3P26022 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTX3P26022 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTX3P26022 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTX3P26022 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTX3P26022 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTX3P26022 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTX3P26022 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTX3P26022 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTX3P26022 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTX3P26022 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTX3P26022 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTX3P26022 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTX3P26022 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTX3P26022 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTX3P26022 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTX3P26022 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTX3P26022 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTX3P26022 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTX3P26022 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTX3P26022 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTX3P26022 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTX3P26022 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTX3P26022 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTX3P26022 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTX3P26022 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTX3P26022 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTX3P26022 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTX3P26022 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTX3P26022 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTX3P26022 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTX3P26022 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTX3P26022 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTX3P26022 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTX3P26022 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTX3P26022 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTX3P26022 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTX3P26022 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTX3P26022 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTX3P26022 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTX3P26022 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTX3P26022 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTX3P26022 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTX3P26022 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTX3P26022 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTX3P26022 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTX3P26022 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTX3P26022 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTX3P26022 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTX3P26022 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTX3P26022 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTX3P26022 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTX3P26022 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTX3P26022 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTX3P26022 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTX3P26022 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTX3P26022 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTX3P26022 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTX3P26022 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTX3P26022 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTX3P26022 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTX3P26022 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTX3P26022 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTX3P26022 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTX3P26022 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTX3P26022 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTX3P26022 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTX3P26022 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTX3P26022 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms