Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
POLR2AP24928 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms