Protein–RNA interactions for Protein: P24863

CCNC, Cyclin-C, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNCP24863 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNCP24863 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNCP24863 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNCP24863 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNCP24863 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNCP24863 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNCP24863 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNCP24863 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNCP24863 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNCP24863 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNCP24863 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNCP24863 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNCP24863 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNCP24863 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNCP24863 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNCP24863 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNCP24863 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNCP24863 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNCP24863 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNCP24863 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNCP24863 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNCP24863 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNCP24863 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNCP24863 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNCP24863 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNCP24863 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNCP24863 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNCP24863 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNCP24863 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNCP24863 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNCP24863 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNCP24863 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNCP24863 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNCP24863 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNCP24863 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNCP24863 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNCP24863 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNCP24863 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNCP24863 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNCP24863 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNCP24863 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCNCP24863 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNCP24863 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNCP24863 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNCP24863 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNCP24863 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNCP24863 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNCP24863 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNCP24863 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNCP24863 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNCP24863 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNCP24863 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNCP24863 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNCP24863 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNCP24863 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNCP24863 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNCP24863 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNCP24863 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNCP24863 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNCP24863 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNCP24863 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNCP24863 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNCP24863 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNCP24863 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNCP24863 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNCP24863 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNCP24863 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNCP24863 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNCP24863 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNCP24863 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNCP24863 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNCP24863 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNCP24863 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNCP24863 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNCP24863 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNCP24863 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNCP24863 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNCP24863 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNCP24863 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNCP24863 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNCP24863 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNCP24863 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNCP24863 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNCP24863 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNCP24863 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNCP24863 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNCP24863 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNCP24863 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNCP24863 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNCP24863 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNCP24863 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNCP24863 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNCP24863 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNCP24863 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNCP24863 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNCP24863 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNCP24863 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNCP24863 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNCP24863 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNCP24863 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms