Protein–RNA interactions for Protein: P23760

PAX3, Paired box protein Pax-3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX3P23760 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PAX3P23760 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PAX3P23760 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PAX3P23760 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PAX3P23760 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PAX3P23760 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PAX3P23760 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PAX3P23760 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PAX3P23760 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PAX3P23760 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PAX3P23760 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PAX3P23760 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PAX3P23760 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PAX3P23760 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PAX3P23760 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PAX3P23760 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PAX3P23760 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PAX3P23760 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PAX3P23760 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PAX3P23760 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PAX3P23760 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PAX3P23760 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PAX3P23760 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PAX3P23760 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAX3P23760 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAX3P23760 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAX3P23760 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAX3P23760 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAX3P23760 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAX3P23760 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAX3P23760 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAX3P23760 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAX3P23760 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAX3P23760 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAX3P23760 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAX3P23760 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAX3P23760 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAX3P23760 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PAX3P23760 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PAX3P23760 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PAX3P23760 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PAX3P23760 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PAX3P23760 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PAX3P23760 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PAX3P23760 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PAX3P23760 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PAX3P23760 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAX3P23760 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAX3P23760 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAX3P23760 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAX3P23760 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAX3P23760 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAX3P23760 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAX3P23760 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PAX3P23760 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAX3P23760 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAX3P23760 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAX3P23760 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PAX3P23760 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAX3P23760 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAX3P23760 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAX3P23760 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAX3P23760 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAX3P23760 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAX3P23760 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAX3P23760 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAX3P23760 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAX3P23760 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PAX3P23760 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAX3P23760 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAX3P23760 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAX3P23760 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAX3P23760 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAX3P23760 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAX3P23760 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAX3P23760 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAX3P23760 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAX3P23760 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAX3P23760 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAX3P23760 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAX3P23760 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAX3P23760 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAX3P23760 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PAX3P23760 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PAX3P23760 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PAX3P23760 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PAX3P23760 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PAX3P23760 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PAX3P23760 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAX3P23760 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAX3P23760 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAX3P23760 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAX3P23760 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAX3P23760 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAX3P23760 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAX3P23760 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PAX3P23760 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PAX3P23760 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PAX3P23760 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PAX3P23760 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms