Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNFSF4P23510 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFSF4P23510 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms