Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPS6KB1P23443 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RPS6KB1P23443 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RPS6KB1P23443 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPS6KB1P23443 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPS6KB1P23443 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPS6KB1P23443 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPS6KB1P23443 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPS6KB1P23443 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RPS6KB1P23443 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPS6KB1P23443 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPS6KB1P23443 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPS6KB1P23443 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPS6KB1P23443 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPS6KB1P23443 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RPS6KB1P23443 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPS6KB1P23443 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPS6KB1P23443 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPS6KB1P23443 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPS6KB1P23443 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPS6KB1P23443 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPS6KB1P23443 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPS6KB1P23443 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPS6KB1P23443 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPS6KB1P23443 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPS6KB1P23443 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPS6KB1P23443 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPS6KB1P23443 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPS6KB1P23443 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPS6KB1P23443 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPS6KB1P23443 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPS6KB1P23443 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPS6KB1P23443 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPS6KB1P23443 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPS6KB1P23443 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPS6KB1P23443 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPS6KB1P23443 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPS6KB1P23443 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPS6KB1P23443 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPS6KB1P23443 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPS6KB1P23443 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RPS6KB1P23443 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RPS6KB1P23443 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RPS6KB1P23443 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RPS6KB1P23443 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RPS6KB1P23443 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPS6KB1P23443 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPS6KB1P23443 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPS6KB1P23443 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPS6KB1P23443 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPS6KB1P23443 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPS6KB1P23443 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPS6KB1P23443 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPS6KB1P23443 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RPS6KB1P23443 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPS6KB1P23443 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPS6KB1P23443 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPS6KB1P23443 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPS6KB1P23443 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPS6KB1P23443 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPS6KB1P23443 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPS6KB1P23443 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPS6KB1P23443 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPS6KB1P23443 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPS6KB1P23443 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPS6KB1P23443 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPS6KB1P23443 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPS6KB1P23443 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPS6KB1P23443 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPS6KB1P23443 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPS6KB1P23443 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPS6KB1P23443 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPS6KB1P23443 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPS6KB1P23443 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPS6KB1P23443 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPS6KB1P23443 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPS6KB1P23443 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPS6KB1P23443 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPS6KB1P23443 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPS6KB1P23443 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPS6KB1P23443 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPS6KB1P23443 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPS6KB1P23443 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPS6KB1P23443 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPS6KB1P23443 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPS6KB1P23443 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPS6KB1P23443 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPS6KB1P23443 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPS6KB1P23443 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPS6KB1P23443 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RPS6KB1P23443 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RPS6KB1P23443 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RPS6KB1P23443 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RPS6KB1P23443 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms