Protein–RNA interactions for Protein: P23378

GLDC, Glycine dehydrogenase (decarboxylating), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLDCP23378 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLDCP23378 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLDCP23378 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLDCP23378 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLDCP23378 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLDCP23378 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLDCP23378 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLDCP23378 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLDCP23378 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLDCP23378 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLDCP23378 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLDCP23378 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GLDCP23378 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLDCP23378 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLDCP23378 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLDCP23378 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GLDCP23378 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GLDCP23378 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GLDCP23378 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GLDCP23378 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GLDCP23378 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GLDCP23378 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GLDCP23378 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GLDCP23378 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GLDCP23378 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GLDCP23378 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GLDCP23378 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GLDCP23378 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GLDCP23378 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GLDCP23378 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GLDCP23378 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GLDCP23378 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GLDCP23378 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GLDCP23378 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GLDCP23378 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GLDCP23378 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GLDCP23378 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GLDCP23378 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GLDCP23378 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GLDCP23378 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GLDCP23378 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GLDCP23378 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLDCP23378 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLDCP23378 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLDCP23378 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLDCP23378 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLDCP23378 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLDCP23378 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GLDCP23378 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLDCP23378 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLDCP23378 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLDCP23378 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLDCP23378 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLDCP23378 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLDCP23378 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLDCP23378 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLDCP23378 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLDCP23378 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLDCP23378 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLDCP23378 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLDCP23378 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
GLDCP23378 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GLDCP23378 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GLDCP23378 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GLDCP23378 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GLDCP23378 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GLDCP23378 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GLDCP23378 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GLDCP23378 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GLDCP23378 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GLDCP23378 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GLDCP23378 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GLDCP23378 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GLDCP23378 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GLDCP23378 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GLDCP23378 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GLDCP23378 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GLDCP23378 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GLDCP23378 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GLDCP23378 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GLDCP23378 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GLDCP23378 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GLDCP23378 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GLDCP23378 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GLDCP23378 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GLDCP23378 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GLDCP23378 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GLDCP23378 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GLDCP23378 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GLDCP23378 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GLDCP23378 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GLDCP23378 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GLDCP23378 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GLDCP23378 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GLDCP23378 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GLDCP23378 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GLDCP23378 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GLDCP23378 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GLDCP23378 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GLDCP23378 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms