Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
HRCP23327 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
HRCP23327 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
HRCP23327 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
HRCP23327 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
HRCP23327 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
HRCP23327 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
HRCP23327 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
HRCP23327 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
HRCP23327 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
HRCP23327 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
HRCP23327 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
HRCP23327 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
HRCP23327 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
HRCP23327 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
HRCP23327 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
HRCP23327 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
HRCP23327 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
HRCP23327 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
HRCP23327 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
HRCP23327 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
HRCP23327 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
HRCP23327 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
HRCP23327 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
HRCP23327 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
HRCP23327 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC34.71■■■■□ 3.15
HRCP23327 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
HRCP23327 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
HRCP23327 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
HRCP23327 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
HRCP23327 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
HRCP23327 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
HRCP23327 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
HRCP23327 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
HRCP23327 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
HRCP23327 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
HRCP23327 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
HRCP23327 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.14
HRCP23327 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
HRCP23327 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
HRCP23327 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
HRCP23327 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
HRCP23327 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
HRCP23327 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
HRCP23327 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
HRCP23327 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
HRCP23327 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
HRCP23327 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
HRCP23327 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
HRCP23327 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
HRCP23327 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
HRCP23327 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
HRCP23327 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
HRCP23327 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
HRCP23327 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
HRCP23327 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
HRCP23327 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
HRCP23327 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
HRCP23327 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
HRCP23327 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
HRCP23327 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
HRCP23327 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
HRCP23327 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
HRCP23327 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
HRCP23327 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
HRCP23327 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
HRCP23327 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
HRCP23327 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
HRCP23327 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
HRCP23327 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
HRCP23327 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
HRCP23327 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
HRCP23327 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
HRCP23327 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
HRCP23327 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
HRCP23327 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
HRCP23327 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.14
HRCP23327 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
HRCP23327 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
HRCP23327 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
HRCP23327 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
HRCP23327 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
HRCP23327 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
HRCP23327 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
HRCP23327 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
HRCP23327 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
HRCP23327 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
HRCP23327 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
HRCP23327 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
HRCP23327 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
HRCP23327 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
HRCP23327 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
HRCP23327 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
HRCP23327 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
HRCP23327 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
HRCP23327 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
HRCP23327 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
HRCP23327 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
HRCP23327 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
HRCP23327 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms