Protein–RNA interactions for Protein: P23109

AMPD1, AMP deaminase 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPD1P23109 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMPD1P23109 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMPD1P23109 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMPD1P23109 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMPD1P23109 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMPD1P23109 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMPD1P23109 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMPD1P23109 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMPD1P23109 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMPD1P23109 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMPD1P23109 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMPD1P23109 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMPD1P23109 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMPD1P23109 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AMPD1P23109 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AMPD1P23109 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AMPD1P23109 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AMPD1P23109 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AMPD1P23109 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AMPD1P23109 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AMPD1P23109 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AMPD1P23109 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
AMPD1P23109 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AMPD1P23109 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AMPD1P23109 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AMPD1P23109 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AMPD1P23109 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AMPD1P23109 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AMPD1P23109 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AMPD1P23109 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
AMPD1P23109 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AMPD1P23109 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AMPD1P23109 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AMPD1P23109 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AMPD1P23109 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AMPD1P23109 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AMPD1P23109 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AMPD1P23109 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AMPD1P23109 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AMPD1P23109 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AMPD1P23109 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
AMPD1P23109 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AMPD1P23109 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AMPD1P23109 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AMPD1P23109 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AMPD1P23109 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AMPD1P23109 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
AMPD1P23109 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AMPD1P23109 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AMPD1P23109 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
AMPD1P23109 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AMPD1P23109 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms