Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACO1P21399 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACO1P21399 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACO1P21399 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACO1P21399 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACO1P21399 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ACO1P21399 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACO1P21399 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACO1P21399 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACO1P21399 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACO1P21399 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACO1P21399 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACO1P21399 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACO1P21399 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACO1P21399 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ACO1P21399 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACO1P21399 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACO1P21399 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACO1P21399 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACO1P21399 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ACO1P21399 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ACO1P21399 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ACO1P21399 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ACO1P21399 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACO1P21399 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACO1P21399 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACO1P21399 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACO1P21399 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACO1P21399 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACO1P21399 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACO1P21399 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACO1P21399 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACO1P21399 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACO1P21399 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACO1P21399 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACO1P21399 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACO1P21399 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACO1P21399 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACO1P21399 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ACO1P21399 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACO1P21399 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACO1P21399 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACO1P21399 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACO1P21399 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACO1P21399 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACO1P21399 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACO1P21399 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACO1P21399 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACO1P21399 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACO1P21399 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACO1P21399 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACO1P21399 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ACO1P21399 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACO1P21399 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACO1P21399 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACO1P21399 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ACO1P21399 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ACO1P21399 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACO1P21399 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACO1P21399 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACO1P21399 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACO1P21399 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACO1P21399 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACO1P21399 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACO1P21399 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ACO1P21399 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACO1P21399 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACO1P21399 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACO1P21399 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACO1P21399 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACO1P21399 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACO1P21399 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACO1P21399 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACO1P21399 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ACO1P21399 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACO1P21399 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACO1P21399 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACO1P21399 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACO1P21399 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACO1P21399 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACO1P21399 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACO1P21399 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACO1P21399 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACO1P21399 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACO1P21399 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACO1P21399 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACO1P21399 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACO1P21399 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACO1P21399 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACO1P21399 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACO1P21399 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACO1P21399 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACO1P21399 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ACO1P21399 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACO1P21399 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACO1P21399 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACO1P21399 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACO1P21399 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACO1P21399 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACO1P21399 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms