Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDCP20941 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PDCP20941 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDCP20941 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDCP20941 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PDCP20941 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDCP20941 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDCP20941 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDCP20941 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDCP20941 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDCP20941 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDCP20941 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDCP20941 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDCP20941 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PDCP20941 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDCP20941 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDCP20941 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDCP20941 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDCP20941 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDCP20941 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PDCP20941 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDCP20941 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDCP20941 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDCP20941 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDCP20941 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDCP20941 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDCP20941 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDCP20941 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDCP20941 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDCP20941 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDCP20941 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDCP20941 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDCP20941 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDCP20941 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDCP20941 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PDCP20941 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDCP20941 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDCP20941 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDCP20941 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDCP20941 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDCP20941 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDCP20941 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDCP20941 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDCP20941 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDCP20941 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDCP20941 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDCP20941 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDCP20941 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDCP20941 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PDCP20941 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDCP20941 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PDCP20941 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDCP20941 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PDCP20941 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PDCP20941 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PDCP20941 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDCP20941 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDCP20941 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDCP20941 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDCP20941 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDCP20941 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PDCP20941 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PDCP20941 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDCP20941 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDCP20941 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDCP20941 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDCP20941 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDCP20941 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDCP20941 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDCP20941 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PDCP20941 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDCP20941 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDCP20941 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PDCP20941 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDCP20941 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDCP20941 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDCP20941 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDCP20941 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDCP20941 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDCP20941 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDCP20941 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDCP20941 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDCP20941 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDCP20941 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDCP20941 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PDCP20941 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDCP20941 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDCP20941 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDCP20941 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDCP20941 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDCP20941 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDCP20941 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDCP20941 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDCP20941 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDCP20941 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDCP20941 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PDCP20941 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDCP20941 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDCP20941 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDCP20941 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms