Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms