Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC9A1P19634 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC9A1P19634 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC9A1P19634 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC9A1P19634 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC9A1P19634 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC9A1P19634 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC9A1P19634 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC9A1P19634 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC9A1P19634 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC9A1P19634 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC9A1P19634 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC9A1P19634 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC9A1P19634 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC9A1P19634 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC9A1P19634 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC9A1P19634 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC9A1P19634 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC9A1P19634 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC9A1P19634 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC9A1P19634 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC9A1P19634 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC9A1P19634 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC9A1P19634 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC9A1P19634 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC9A1P19634 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC9A1P19634 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC9A1P19634 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC9A1P19634 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC9A1P19634 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC9A1P19634 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC9A1P19634 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC9A1P19634 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC9A1P19634 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC9A1P19634 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC9A1P19634 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC9A1P19634 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC9A1P19634 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC9A1P19634 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC9A1P19634 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC9A1P19634 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC9A1P19634 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC9A1P19634 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC9A1P19634 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC9A1P19634 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC9A1P19634 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC9A1P19634 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC9A1P19634 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC9A1P19634 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC9A1P19634 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC9A1P19634 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC9A1P19634 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms