Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCLP19338 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCLP19338 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCLP19338 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCLP19338 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCLP19338 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCLP19338 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCLP19338 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCLP19338 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCLP19338 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCLP19338 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCLP19338 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCLP19338 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCLP19338 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NCLP19338 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NCLP19338 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NCLP19338 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NCLP19338 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NCLP19338 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NCLP19338 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NCLP19338 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NCLP19338 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NCLP19338 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NCLP19338 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NCLP19338 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NCLP19338 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NCLP19338 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NCLP19338 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NCLP19338 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCLP19338 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCLP19338 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCLP19338 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCLP19338 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCLP19338 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCLP19338 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCLP19338 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCLP19338 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCLP19338 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCLP19338 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCLP19338 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCLP19338 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCLP19338 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCLP19338 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCLP19338 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCLP19338 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCLP19338 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NCLP19338 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCLP19338 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NCLP19338 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCLP19338 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCLP19338 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCLP19338 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCLP19338 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCLP19338 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCLP19338 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCLP19338 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCLP19338 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NCLP19338 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCLP19338 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCLP19338 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCLP19338 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NCLP19338 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCLP19338 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NCLP19338 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCLP19338 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NCLP19338 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCLP19338 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCLP19338 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCLP19338 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCLP19338 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCLP19338 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCLP19338 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCLP19338 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCLP19338 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCLP19338 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NCLP19338 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCLP19338 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCLP19338 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCLP19338 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCLP19338 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCLP19338 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCLP19338 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCLP19338 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCLP19338 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCLP19338 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCLP19338 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCLP19338 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCLP19338 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCLP19338 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCLP19338 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCLP19338 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NCLP19338 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NCLP19338 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NCLP19338 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NCLP19338 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NCLP19338 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NCLP19338 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NCLP19338 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NCLP19338 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NCLP19338 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms