Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD58P19256 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD58P19256 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD58P19256 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD58P19256 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD58P19256 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD58P19256 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD58P19256 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD58P19256 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD58P19256 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD58P19256 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD58P19256 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD58P19256 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD58P19256 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD58P19256 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD58P19256 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD58P19256 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CD58P19256 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD58P19256 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD58P19256 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD58P19256 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD58P19256 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CD58P19256 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD58P19256 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD58P19256 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD58P19256 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD58P19256 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD58P19256 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD58P19256 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD58P19256 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD58P19256 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD58P19256 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD58P19256 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD58P19256 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD58P19256 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD58P19256 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD58P19256 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD58P19256 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD58P19256 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CD58P19256 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD58P19256 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD58P19256 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD58P19256 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD58P19256 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CD58P19256 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CD58P19256 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CD58P19256 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD58P19256 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD58P19256 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CD58P19256 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CD58P19256 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CD58P19256 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CD58P19256 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD58P19256 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD58P19256 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CD58P19256 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD58P19256 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD58P19256 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD58P19256 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD58P19256 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD58P19256 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD58P19256 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD58P19256 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CD58P19256 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD58P19256 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD58P19256 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD58P19256 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD58P19256 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD58P19256 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD58P19256 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD58P19256 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD58P19256 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD58P19256 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD58P19256 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD58P19256 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD58P19256 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD58P19256 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD58P19256 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD58P19256 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD58P19256 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD58P19256 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD58P19256 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD58P19256 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD58P19256 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD58P19256 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD58P19256 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CD58P19256 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD58P19256 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD58P19256 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD58P19256 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD58P19256 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD58P19256 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CD58P19256 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD58P19256 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD58P19256 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD58P19256 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CD58P19256 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CD58P19256 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CD58P19256 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD58P19256 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms