Protein–RNA interactions for Protein: P18850

ATF6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6P18850 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF6P18850 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF6P18850 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF6P18850 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF6P18850 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF6P18850 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF6P18850 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF6P18850 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF6P18850 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF6P18850 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF6P18850 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF6P18850 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF6P18850 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF6P18850 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF6P18850 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF6P18850 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF6P18850 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF6P18850 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF6P18850 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF6P18850 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF6P18850 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF6P18850 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF6P18850 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF6P18850 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF6P18850 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF6P18850 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF6P18850 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF6P18850 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF6P18850 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF6P18850 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF6P18850 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF6P18850 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF6P18850 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF6P18850 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF6P18850 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF6P18850 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF6P18850 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF6P18850 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF6P18850 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF6P18850 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF6P18850 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF6P18850 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF6P18850 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF6P18850 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF6P18850 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF6P18850 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF6P18850 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF6P18850 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF6P18850 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF6P18850 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF6P18850 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF6P18850 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF6P18850 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF6P18850 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF6P18850 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF6P18850 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF6P18850 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF6P18850 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF6P18850 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF6P18850 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF6P18850 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ATF6P18850 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ATF6P18850 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF6P18850 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF6P18850 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF6P18850 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF6P18850 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF6P18850 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF6P18850 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF6P18850 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF6P18850 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF6P18850 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF6P18850 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF6P18850 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF6P18850 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF6P18850 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF6P18850 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF6P18850 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF6P18850 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF6P18850 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF6P18850 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF6P18850 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF6P18850 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF6P18850 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF6P18850 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF6P18850 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF6P18850 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF6P18850 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF6P18850 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF6P18850 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF6P18850 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF6P18850 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF6P18850 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF6P18850 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF6P18850 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF6P18850 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF6P18850 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF6P18850 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF6P18850 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF6P18850 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms